Francesco Bagnaia zapewnił absolutnie ekscytujący występ, zdobywając pole position w Malezji, bijąc poprzedni rekord okrążenia z czasem 1:56.337. Panujący mistrz wykonał perfekcyjne okrążenie, zyskując przewagę nad Jorge Martinem. Jednakże Martin również zdołał przekroczyć 1:56, ale nie był w stanie dorównać tempu Bagnai podczas drugiego przejazdu. Obok Bagnai i Martina w pierwszym rzędzie ustawi się Alex Marquez, którego mocne okrążenie zapewniło mu trzecie miejsce.

Podczas FP2 zawodnicy i zespoły skupili się na dopracowaniu ustawień, a Bagnaia zakończył sesję najszybciej obok Martina. Scena była przygotowana na ekscytującą sesję kwalifikacyjną, w której Marco Bezzecchi ustanowił niesamowite tempo w Q1. W miarę postępu sesji czasy zaczęły gwałtownie spadać, a Johann Zarco i Brad Binder zajęli czołowe miejsca i awansowali do Q2.

W Q2 Martin rozpoczął mocno, z pierwszym przejazdem w zakresie 1:56. Następnie poprawił swój czas, ale później został pokonany przez Bagnaię, który wykonał absolutnie perfekcyjny przejazd i zajął pole position. Panujący mistrz wycisnął z siebie maksimum możliwości. Niestety, kolega z zespołu Bagnaia, Enea Bastianini, uległ wypadkowi w ostatnich chwilach sesji.

Franco Morbidelli stanie na czele drugiego rzędu po imponującym starcie w Q2, który zapewnił mu czwarte miejsce. Ustawi się on przed Marcem Marquezem, który miał trudności ze znalezieniem dodatkowej prędkości na świeżych oponach i wystartuje z piątego miejsca. Bastianini, który rozbił się w ostatnich chwilach, uzupełni drugi rząd na szóstym miejscu, ponieważ nie był w stanie poprawić swojego czasu.

Jack Miller wystartuje z siódmego pola, pokazując się z dobrej strony podczas weekendu. Dołączą do niego Fabio Quartararo i Alex Rins, a obie Yamahy prezentują się w Malezji bardzo dobrze.

Pedro Acosta nieznacznie przegapił Q2, kwalifikując się na 13. miejscu. Debiutant wystartuje przed Marco Bezzecchim i Raulem Fernandezem. Andrea Iannone, ikona powrotu, ustawi się na 17. pozycji, kontynuując swój imponujący powrót do MotoGP.