Il Motomondiale è ufficialmente tornato per il Gran Premio del Giappone, che ha preso il via in grande stile con Francesco Bagnaia a dettare il ritmo. La pioggia era nell'aria durante le FP1, e una volta iniziato, nessuno è riuscito a superare il tempo di Bagnaia. Ha concluso la sessione davanti al suo rivale Jorge Martin, che è apparso in forma smagliante sul circuito stop-and-go. Martin è ora in testa al campionato in vista del fine settimana. Fabio Di Giannantonio ha completato la top 3, nonostante abbia percorso solo otto giri.

Marc Marquez ha conquistato il quarto posto, debuttando con un casco speciale per il Gran Premio del Giappone. Jack Miller ha disputato un'ottima FP1 e il pilota della KTM ha concluso al quinto posto. In passato ha ottenuto molti successi su questa pista. Marco Bezzecchi ha conquistato il sesto posto e Joan Mir il settimo.

Johann Zarco ha mostrato una forma solida, conquistando l'ottavo posto, mentre Maverick Viñales è stato il miglior pilota Aprilia in nona posizione. Enea Bastianini ha conquistato l'ultimo posto nella top ten, ricevendo un forte sostegno dal pubblico giapponese. Franco Morbidelli ha avuto una sessione difficile, terminando al 18° posto. Lorenzo Savadori, che ha sostituito Miguel Oliveira, ha chiuso al 22° posto, mentre la wildcard Yamaha Remy Gardner ha terminato le FP1 al 23° posto.