Le MotoGP est officiellement de retour pour le Grand Prix du Japon, et il a démarré en beauté avec Francesco Bagnaia qui a donné le ton. La pluie était de la partie pendant la FP1, et une fois qu'elle a commencé, personne n'a pu battre le temps de Bagnaia. Il a terminé la séance devant son rival Jorge Martin, qui s'est montré très à l'aise sur ce circuit où les arrêts sont fréquents. Martin est désormais en tête du championnat avant le week-end. Fabio Di Giannantonio complète le trio de tête, même s'il n'a bouclé que huit tours.

Marc Marquez a pris la quatrième place, étrennant un casque spécial pour le Grand Prix du Japon. Jack Miller a réalisé une bonne première séance d'essais libres, le pilote KTM terminant cinquième. Il a connu de nombreux succès sur ce circuit par le passé. Marco Bezzecchi a pris la sixième place et Joan Mir la septième.

Johann Zarco s'est montré solide en prenant la huitième place, tandis que Maverick Viñales a été le meilleur pilote Aprilia en neuvième position. Enea Bastianini s'est emparé de la dernière place du top 10, bénéficiant d'un fort soutien de la part du public japonais. Franco Morbidelli a connu une séance difficile, terminant à la 18e place. Lorenzo Savadori, qui a remplacé Miguel Oliveira, a terminé 22e, tandis que Remy Gardner, le wildcard de Yamaha, a terminé la FP1 en 23e position.